Мир постепенно восстанавливается, но количество преступлений Мавериков растет во вновь построенных городах. X пытается ответить на вопросы, мучавшие его с момента вступления в организацию Maverick Hunters: "Правильный ли путь мы выбрали для решения проблем с Мавериками?", "Сколько еще может продолжаться эта война?".

История начинается через три недели после событий Mega Man X5. Zero пропал без вести и считается погибшим. Земная поверхность стала необитаемой. Среди Реплоидов распространяются слухи о Маверике по имени Zero Nightmare, распространяющего хаос по всему миру. X, разгневанный тем, что этот Маверик использует имя его покойного друга, отправляется на поиски Zero Nightmare.

В этой части, как и в других, есть сюжет, что плохо, потому что его не понять, а хочется. Кратко: XXII век, всё плохо, человечество сражается с плохими ребятами. Проблема №1: Земля может столкнуться то ли с астероидом, то ли с чем-то ещё, а устроили всё это те самые злые существа. Проблема №2: сбить то, что летит, можно только из Большой Пушки, но реплоиды разобрали её на части, части надо собрать. Проблема №3: есть некий вирус, из-за которого хорошие существа (реплоиды) превращаются в плохих (Бродяг), да и самого Мегамена он может поразить. То есть всё настолько плохо, что это даже хорошо.

Четвертая часть одного из самых лучших платформеров всех времен и платформ.

Вам предстоит играть за лидера подразделения Maverick Hunters, специализирующегося на отлове неповинующихся роботов, Megaman X, или же за его друга, Zero. Два эти персонажа не только имеют абсолютно разное вооружение, но и сюжетная линия с диалогами у каждого из них немного разнится, что добавляет интереса, если вы решитесь пройти игру по второму разу.

В 21XX году доктору Допплеру (Dr. Doppler) удалось полностью нейтрализовать вспышки агрессивности у роботов. Некоторое время казалось, что теперь агентство по борьбе с неподконтрольными роботами Maverick Hunters можно будет распустить. Лишь спустя несколько месяцев открылось, что Допплер создал себе непобедимую армию, состоящую из все тех же роботов, и теперь собирается уничтожить единственную оставшуюся угрозу - штаб квартиру Maverick Hunters. Megaman'у и Zero придется приложить немало усилий, чтобы этого не допустить.

Gods - это платформер с обилием драк и головоломок, основанный на мифологии Древней Греции. Вашему герою предстоит выбраться из запутанного города-лабиринта, наводненного разнообразными, монстрами и боссами, которых необходимо победить.

Prehistoric2 - это симпатичная аркадка с великолепной (на 1993 год) графикой. Некоторые вещи в ней валяются на поверхности, а некоторые нужно выбивать своей дубинкой, для 100% прохождения уровня.
В игре 9 уровней, два вида сложности, множество разнообразных монстриков, бонусов и потайных мест.